河北省微生物多样性研究与应用实验室成立于2006年1月。实验室定位是：面向京津冀区域乃至我国生物产业发展需求，开展微生物组研究与资源开发利用研究，加快原创性研究成果的产出；发展总体目标是：建成微生物研究、保育基地和生物产业技术、产品的创新研发基地、微生物高层次人才培养基地，建设一流水平微生物学科。创始人为张利平教授，实验室现任主任为吕志堂教授。现任学术委员会主任为中国科学院微生物研究所庄文颖院士。
实验室长期从事微生物多样性研究、菌种选育和微生物资源开发利用，菌种库保藏有各类微生物4万余株，在微生物系统学与生物多样性研究、新型天然产物或功能菌株筛选及微生物育种、农业废弃物资源化利用及水体生物修复等领域具有优势，成功研发成功我国首个具有自主知识产权的谷胱甘肽生产菌种及发酵工艺、在国际上首先建立了生物转化法生产5-羟基色氨酸技术，均已实现产业化。
实验室现有固定人员31人，形成了微生物系统学与生物多样性、微生物资源研究与开发、生物修复技术三个研究稳定方向，主要学术带头人有吕志堂、罗都强、王启明、刘晓云、张秀敏、刘存歧等教授。长期与中国科学院微生物研究所、华北制药集团等研究机构和企业建有合作关系。
